Uzrok nastanka ovih promjena su kromogene bakterije koje svojim metabolizmom stvaraju pigment. Kromogene bakterije u usnoj šupljini same po sebi nisu patološke, no stvaraju neugodne pigmentacije po zubima.
Radi se zapravo o anaerobnoj bakteriji Bacteroides melanogenicus koja čini dio prirodne flore usne šupljine. Međutim kod povećanja broja bakterija u usnoj šupljini, loše oralne higijene, hrapavosti zubne površine, pušenja i drugih faktora dolazi do stvaranja pigmentacija na zubima.